少林庙头心意拳是少林武术中的一支奇葩，是少林武术的精华之一。少林武术发源于河南登封县嵩岳少室山北麓五乳峰下的少林寺，是以嵩山少林寺为中心的武僧在长期的传习过程中，吸收中国传统武术及民间武技、气功、养生等精华，创编提高，不断发展起来的搏击技术。少林庙头心意拳起源于隋朝开皇年间的“上柱国”“平南王大将军”韩擒虎，由居住在河南新安县庙头村韩王庙的护庙侍卫传承演绎，逐渐流传至今，已有一千四百多年的历史。
在远古时期，人类和其他动物一起生活，而人类飞不如禽类，跑不如野兽，野兽以利爪尖牙袭击人类，人类只能以聪明智慧的格斗手段来制服野兽，技击之术逐渐开始盛行，至氏族社会时期，物产丰富谷粮增多，人们为了争夺财物地盘互相残杀掠夺，常年征伐战斗，使搏击格斗之术进一步趋于完善，荀子云：“齐人隆技击”。汉书曰：“齐民技击强”，这充分说明了在人类产生的很早时期就出现了技击搏斗技术。
北魏太和十九年（即公元495年），孝文帝跋拓宏为安顿印度沙门跋陀落迹传教，在登封城西少室山阴的五乳峰下敕建“少林寺”。佛陀曾收弟子僧稠和慧光，都是通经好武的行家里手，据说慧光在洛阳天街井口反踢踺子，一连五百，可见人小胆大。稠禅师因每次以劣弱见凌，从而发奋习武，乞神赐力，居然练得筋骨强劲，拳捷骁武，后曾以神力显于文宣帝，锡杖中解王屋山恶虎交斗，引重千钧。少林寺庙里最早的和尚“每休暇，常角力，腾越为戏”，由此可知他们应该才是少林武术最早的创始者和继承人。
相传佛祖释迦摩尼在灵鹫山上拈花示众，传法迦叶，由此这种“拈花微笑，心心相印”的教外别传，历经二十八代，由般若多罗传给二十八祖菩提达摩，达摩出师后，于北魏孝明帝孝昌三年（公元527年）从海上取道来到中国南京，由于和梁武帝话不投机，于是便一苇渡江来到北魏国都洛阳，达摩随其所至，诲以禅教，杖锡于秦，游化嵩洛，至少室山，面壁坐禅，寂坐参悟九年，传经布道，之后的少林武术在既往传承拳棒的基础上,大量吸收了达摩大师很多的禅坐精华，形成了蜚声海外的一代少林派拳术。
少林寺僧人很早就常角力腾跃为戏，拳棒练习不绝，少林僧人由于助唐有功，太宗即位后，赐寺田四十顷，盖殿宇僧房两千余间，僧众多达两千余人，并准许吃肉饮酒，寺内建立僧兵，由此少林寺处于极盛时期，被誉为“天下第一名刹”。少林寺养僧兵后，为了提高实战能力，不仅练拳术、器械，而且也加强了对轻功、气功、马术的研讨，经常邀请各地武术名人入寺传艺指教,各方武术名人也慕名而至，传经送宝,这样少林寺实际上已成为全国会武之地，使它有机会博采众家之长，集武术精华于少林，同时少林武术也得以广为流传。宋初少林寺福居大师，曾先后汇集归纳了宋太祖赵匡胤的长拳、韩通的通背拳、马藉的短打等十八家拳法精华，著成拳谱，传流后世。
金元时期，原有武术功底的觉远和尚到少林寺出家后，不满足于少林寺原有的武术水平，携资西出，访名师于山西、陕西、甘肃兰州等地，聘请名师李叟、白玉峰入寺传授武艺，李叟传授大、小洪拳，棍术，擒拿术，白玉峰传授气功及龙、虎、蛇、鹤拳等。还有福裕和尚，因保国有功，曾被元王朝封为晋国公（至今寺内存有碑刻），至宋元时期，少林寺僧兵有增无减，绵延不绝，曾多次参加抗金战争，屡立奇功。元至正初年，曾有厨下僧，篷头裸背跣足，寡言少语，闲暇闭目打坐，偶尔亦习拳棒，红巾军入寺抢掠时，持棍变形独立高峰怖遁红巾，从此紧那罗王被奉为少林寺护珈蓝神，历代敬奉！
从少林寺碑刻、塔铭等资料可知，少林寺第一位战功显赫的僧兵是三奇周友，所赏“三奇和尚”，即获奇功、首功、次功，周友获三次奇功，可见其英勇善战，武艺高强。周友号称“天下对手，教会武僧”，有僧俗弟子千余人，其法侄洪转，也是著名武僧，万历初年著有《梦绿堂枪法》。之后少林寺武僧还参加征讨师尚诏和抗击倭寇等战斗。明世宗嘉靖后期，少林僧兵参加抗倭战争。嘉靖年间最有名的和尚是小山宋书和尚，二十岁入少林寺，勤习八年，武艺超群，智勇兼备，曾三次挂帅征边，屡立战功，皇上为他在少林寺门前立石狮和旗竿，以嘉其功。
传说少林寺有位扁囤和尚，礼梵僧哈麻为师，师授《心经》，武艺高强。程宗猷《少林棍法阐宗》曾说哈麻师“以拳棍授扁囤”，并传授紧那罗神咒。明代万历年间抗倭名将俞大猷，从师多位武术名流，得少林寺“神传长剑技”，留《剑经》名著于少林。洪转的俗家弟子程冲斗，在少林寺学习“夜叉棍 ”十多年，著有《少林棍法阐宗》三卷，明末杭州人陈元赟（yūn），又将少林武术于1638年传于日本国。
清朝，由于朝廷禁教少林武术而遭到压制和禁止，武僧练武由公开变为隐蔽，清道光八年三月，麟庆祭祀中岳庙，问拳法 “少林拳勇，自昔有闻，只在谨守名山，不必打诓语”。主僧选健僧校拳，熊经鸟伸，果然矫捷。少林武术声誉更加卓著，流传更加广泛，在社会上流传的更广更快，很重要的原因在于民间秘密结社性质的反清教会、帮会，利用少林武术、宣传少林武术。在康熙后期，少林武术在社会上的传播已相当广泛，不仅天地会说武艺出在少林寺，民间习武者也沿习教会、帮会的说法，说自己的武艺出自知名的少林寺。清康熙时长洲人褚人矱《坚瓠集》：“今人谈武艺，辄曰：‘从少林寺出来’。”实际上就是后来所说的“天下功夫出少林”的早期表述。
民国时期虽然少林寺已没落，但少林寺僧仍保持习武的传统。民国初年，少林寺最具影响力的两位武术大师是恒林和妙兴。恒林和尚参禅之外，兼习拳棒，武艺高强，精通少林各种功法，曾任少林寺武僧教头和住持，武术弟子众多。民国时少林寺武术弟子中还走出了许世友、钱钧两位将军，他们在战场上大显身手，屡立战功，1955年许世友被授予上将军衔，钱钧被授予中将军衔。
1928年，建国豫军樊钟秀以少林寺为司令部，袭其后方，石友三攻入少林寺，一把大火将重要殿堂焚毁，寺内所存少林武术资料被焚殆尽，寺内武僧四处逃散，少林武术奄奄一息，当家武僧贞绪与素典、德禅等重振少林武术，并召回著名还俗武僧寂勤，俗子吴三林大师，训练少林武僧，培养了德根、行章等40余名武僧。同时还在少林寺创办的少林中学中开设少林武术课，贞绪、德根等武僧的演武、传武活动维系了民国时期少林寺武术的传承。
少林寺僧在经历了北魏至元代长期的习武之后，到了明代，经过武僧不断演练、综合、传承、提高，形成了完整的少林武术体系。少林寺武术名扬天下，少林武术博采众长，形式多样，内容丰富，特点突出，风格独特，是中华武术的重要组成部分。少林寺棍棒自古即兴，汇集众长，而后融汇达摩禅法才形成了如今的少林武术，而少林武术的精华即是心意拳，盖此即少林庙头心意拳之源渊也。